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    上海 金山区

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    试剂、细胞库 / 细胞培养

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我司ELISA试剂盒指出应用于农业和水产养殖的样品

461 人阅读发布时间:2019-08-13 15:00

ELISA试剂盒通过分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化,开发的这个流程依赖于脊椎动物中DNA甲基化的非随机分布,大多数甲基化都位于CpG位点。在这个方法中,DNA先通过限制性内切酶Mspl和/或Taql消化,这两种酶分别切割C^CGG和T^CGA,并且对甲基化不敏感。之后,这些消化后的序列被用来创建RRBS测序文库。
利用九个物种(人、小鼠、大鼠、牛、狗、鸡、鲤鱼、鲈鱼和斑马鱼),验证和优化了96孔RRBS方法的基因组覆盖度和样品通量,将所覆盖的CpG位点数量从250万个提高到400万个。利用了RRBS读取的特点,如明确的起始和中止点。通过汇集特定物种中所有样品的RRBS读取,这个应用程序推断出每个集群的一致序列。在胞嘧啶和胸腺嘧啶同时存在的情况下,胞嘧啶被保留,因为这可能反映了甲基化的胞嘧啶。
ELISA试剂盒为了验证这种方法,将其应用在三个物种(人、牛和鲤鱼)的44个样品中,并比较了无参考和有参考的分析。他们发现,对于两种方法,CpG位点的平均DNA甲基化水平在很大程度上是相似的。同时,推导的基因组也大体反映了参考基因组。例如,1,522,786个推导基因组片段中的1,254,324个可比对到人类基因组。
对代表性染色体的比对位置进行作图时,发现这两种方法有着很好的一致性,而对于所有样品和所有物种,这两种方法所获得的DNA甲基化值也高度一致。

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